Los tanques de regulación como su nombre indica sirven para regular o ajustar el peso del submarino de modo tal que se corresponda con el desplazamiento en inmersión.
Estos tanques se encuentran situados en la zona central del buque y dentro de lo posible lo más cerca del centro de empuje en inmersión se suelen encontrar dentro del casco resistente aunque en algunos casos están fuera del mismo y en un tanque de lastre al efecto o  en tanques de combustible. La capacidad de los tanques de regulación está entre el 2,5% y el 3 % del desplazamiento del casco estanco o resistente.
Los tanques de regulación pueden ser inundados o achicados desde o hacia el mar con ayuda de una de las bombas de achique.

En cualquier caso también pueden soplarse con aire de alta presión por el poco ruido que produce este método y al mismo tiempo se evita depender de la energía eléctrica para el achique en caso de emergencia. Están construidos con una resistencia suficiente para soportar las altas presiones a que se pueden ver sujetos durante la inmersión. Por otra parte los tanques de regulación ventilan al interior del submarino.
El número de tanques de regulación es de dos o cuatro tanques siendo generalmente usado el número de cuatro que operan como sigue: dos sirven con ventilaciones abiertas como reguladores de inundación y los otros dos con ventilaciones cerradas sirven para trasiego de agua sin ruido maniobra efectuada con ayuda del aire comprimido.
Los tanques de regulación ajustan las siguientes diferencias de peso:

1) Diferencias entre las densidades de agua de mar.
Como sabemos las densidades del agua de mar no son en todos los mares iguales ni siquiera en una zona pues en las cercanías de las desembocaduras de los ríos es más baja. La densidad del agua de mar oscila entre 1,008 y 1,028 las zonas de menor densidad corresponden a estuarios de ríos o rías y las de mayor densidad, por lo general a alta mar, en zonas tropicales y subtropicales bajando considerablemente en las zonas de los mares polares y alcanzando por ejemplo en el mar Báltico una densidad en torno a 1,012.
Esto significa que un metro cúbico de agua dulce pesa 1 tonelada pero la misma cantidad de agua salada oscila entre los 1008 kilos de la zona de menor densidad (1,008) y los 1028 kilos en zonas de máxima densidad (1,028). Para sumergirse en esas zonas se debe compensar con los tanques de regulación un 2% del desplazamiento. El problema no surge por el peso del agua embarcada sino por el mayor empuje en aguas de mayor densidad.

2) Diferencias por el consumo de víveres, agua dulce, combustible, aceite de motores y todo aquello susceptible de ser consumido.
Es evidente que según van pasando los días de navegación se consume  de todo lo anteriormente citado y hay que compensar las diferencias de peso producidas por dichos consumos, con el llenado de agua de mar en los tanques de regulación y lastres.

3) Diferencias por inmersión a grandes profundidades.
Aquí también debemos de tener en cuenta que a mayor profundidad mayor presión y por tanto el volumen del submarino disminuye y por tanto su desplazamiento por lo cual se debe  compensar un 0,3%  durante inmersiones a menos de 200 metros.

Los tanques de nivelación sirven para llevar verticalmente el submarino bajo el centro de carena en inmersión, con el fin de que el submarino pueda quedar nivelado con su peso equilibrado los tanques se situan dentro del casco resistente lo más a proa y a popa posible.
Estos tanques están conectados por tuberías entre sí tal y como vemos en el esquema el agua entre ellos se trasiega por medio de una bomba o por baja presión de aire, procedimiento éste menos ruidoso que el de la bomba, el cálculo de la resistencia de estos tanquesestá basado en el nivel de la presión empleada.

La cantidad aproximada de agua necesaria para la nivelación es la mitad del volumen total de los tanques de nivelación. Para el cálculo de la capacidad de estos tanques se parte de los casos de límite de carga, como en el caso del cálculo de los tanques de regulación. Para el cálculo se tiene en cuenta además los desplazamientos de pesos originados por el empleo de los torpedos.

Respecto al peso del agua de nivelación, decir que alcanza aproximadamente un 0,5% del volumen del casco resistente.

Un dato sobre los submarinos alemanes es que hasta 1943 había la posibilidad de conectar una bomba de pistón para achique a través de una válvula selectora, pero debido al excesivo ruido del sistema se abandonó.

El circuito sirve para nivelar el submarino y su funcionamiento es como sigue:
Una vez sumergido a la profundidad deseada el submarino se situa en posición horizontal, supongamos para este caso que necesitamos que el submarino pese de popaentonces abrimos la válvula (13) y situamos la (14) de modo que el airevaya hacia el tanque de proa (7) y empuje el agua hacia el tanque de popa (1) el aire que contiene el tanque de popa va saliendo en dirección hacia la sentina (15) a través de la válvula (14).
El sistema para regular por bombeo funciona a través del aparato de control de trimado (3) por medio del cual se aspira agua de uno de los tanques y se pasa al que se precisa inundar más.

Los colores indican la utilidad de cada línea y sirven para hacer el dibujo más fácil de entender.

• El naranja es el correspondiente al colector de achique de sentinas y tanques, que va desde proa a popa.
• El azul turquesa corresponde a las líneas principales de las bombas para achique e inundación.
• El verde corresponde a la inundación y achique de los tanques de regulación.
• El azul corresponde a la línea de aire comprimido para los tanques de nivelación.
• El amarillo son los fosos de los periscopios.
• El negro corresponden otras líneas de achique e inundación incluyendo la línea para la alimentación de la planta potabilizadora  

Los tanques de compensación de torpedos sirven para compensar el peso de los torpedos ya lanzados en el esquema vemos como funciona el sistema: