12 Patrullas, 51 buques hundidos (306.875tn) 3 dañados, 1 Trainera Armada (1.060tn) hundida.

1a Patrulla
Zarpa de Kiel el 19 de Agosto de 1939 para patrullar en el Atlántico al Oeste del Golfo de Biscaya con la 7a U-Flottillen.
El U48 estaba patrullando al Noroeste de Cabo Ortegal cuando el 5 de Septiembre se encontró con el SS.Royal Sceptre (británico 4.853tn), tras un cañonazo de advertencia el buque británico no se detuvo y envió un mensaje de emergencia. El siguiente cañonazo impacto en el buque y la tripulación abandonó el buque, entonces Schultze torpedeó al mercante. El radio operador del mercante que continuaba abordo radiando la posición del ataque se fue al fondo con el barco. Un poco más tarde el U48 detuvo al buque británico SS.Browning con un cañonazo por delante de su proa, la tripulación abandonó de inmediato el mercante. Schuktze se acercó a la posición de los botes salvavidas y les ordenó regresar a su barco y recoger a los tripulantes del SS.Royal Sceptre. EL SS.Browmning (británico 5.332tn) fue hundido por el U595 cerca de Oran el 21 de Noviembre de 1942.
El U48 fue uno de los diez uboot que el día 7 de Septiembre se les ordenó regresar a la base para preparar la campaña del Atlántico.
De regreso hundió al SS.Winkleigh (británico 5.055tn) al Suroeste de Irlanda el día 8 de Septiembre y al SS.Firby (británico 4.869tn) al Norte de Rockall el día 11 de Septiembre.
EL U48 regresó a Kiel el 17 de Septiembre de 1939.

2a Patrulla
Zarpa el día 4 de Octubre de 1939 de Kiel hacia el Atlántico para participar en el primer intento de Manada de Lobos con otros cuatro uboot, todos ellos bajo el mando táctico embarcado en el U37.
De camino al punto de encuentro, por la tarde del día 12 de Octubre, localizó al SS.Emile Miguet (francés 14.115tn) que se había rezagado del convoy KJ2 al Suroeste de Fastnet, el U48 detuvó al mercante con un cañonazo, a unas millas de distancia el SS.Heronspool (británico 5.202tn) un rezagado del convoy OB17 oyó el cañonazo e hizo sonar su alarma para que la tripulación ocupara sus puestos de combate. Schultze debió oir la alarma ya que tras hundir al buque francés persiguió al británico, tras un intercambio de cañonazos el SS.Heronspool fue hundido con un torpedo.
El día 13 de Octubre por la mañana el U48 hundió al SS.Lousiane (francés 6.903tn) del convoy OA17 al Suroeste de Fastnet. Al mediodía del día 14 de Septiembre hudió al SS.Sneaton (británico 3.677tn) al Suroeste de Fastnet.
Tres de los uboot que debían formar parte de la Manada de Lobos fueron hundidos en el trayecto (U40, U42 y U45). El día 16 el U46 divisó al convoy HG3, avisó a los otros dos uboot (U37 y U48), el contacto con el convoy se perdió pero se volvió a localizar al Noroeste de Cabo Finisterre. Tres buques fueron hundidos durante un ataque al aterdecer del día 17 de Octubre. El U48 hundió al SS.Clan Chisholm (británico 7.256tn). Los numerosos fallos en los torpedos permitieron escapar a la mayoría de barcos del convoy.
El U48 regresó a Kiel el 25 de Octubre de 1939.

3a Patrulla
Zarpa el 20 de Noviembre de 1939 de Kiel hacia las Orkneys para operar contra las fuerzas navales británicas.
El día 27 el U48 hunde al buque cisterna MV.Gustaf E.Reuter (sueco 6.336tn) al Noroeste de la Isla de Fair.
Tras recibir ordenes de patrullar al Oeste del canal de la mancha el U48 pone proa al Sur el día 28. El 8 de Diciembre ataca al convoy OB48 al Sureste de Fastnet, tras la medianoche hunde al SS.Brandon (británico 6668tn) y a primera hora del día 9 daña al buque cisterna MV.San Alberto (británico 7.397tn). El buque cisterna fue abandonado y hundido por un escolta del convoy el día 12 de Diciembre.
El día 15 de Diciembre el U48 hundiría al SS.Germaine (griego 5.217tn) al Suroeste de Irlanda.
El U48 inició el regreso a la base y al pasar por el Canal de la Isla de Fair el día 19 ya no había ningún uboot en el Atlántico.
El U48 llegó a Kiel el 20 de Diciembre de 1939.

4a Patrulla
Zarpa de Kiel el 24 de Enero de 1940 para realizar operaciones de minado en la zona de Weymouth que no tuvieron consecuencias. Tras esto el U48 de dirigió a la entrada Oeste del Canal de la Mancha para operar al Suroeste de las Scillies. En esa zona hundió el día 10a de Febrero al SS.Burgerdijk (holandés 6.853tn) el día 14 de Febrero al SS.Sultan Star (británico 12.306tn) y el día 15 hundiría al buque cisterna MV.Den Haag (holandés 8.971tn).
El día 17 al Sur de Bishop Rock el U48 hundiría al SS.Wilja (finalndés 3.396tn).
En esta patrulla el U48 atacaría sin éxito a una fuerza naval británica formada, entre otros, por el HMS.Ark Royal y al HMS.Renown.
El U48 regresó a Kiel el 26 de Febrero de 1940.

5a Patrulla
Zarpa el 3 de Abril de Kiel bajo ordenes selladas, para tomar parte de la operación Hartmut (invasión de Noruega). El día 6 cuando son abiertas las ordenes selladas todos los uboote toman posiciones en las costas Noruegas donde a partir del día 9 dieron apoyo a las tropas alemanas de desembarco y a los transportes marítimos ante posibles ataques de fuerzas británicas.
El U48 se unió al 5º Grupo Uboot que debía operar al Noreste de las Shetlands. El día 10 de Abril a los uboot del grupo se les ordena dirigirse a Narvik que las fuerzas alemanas estaban defendiendo. De camino al U48 y al U49 son desviados a otros fiordos donde se esperaba el desembarco de tropas británicas. El U48 probablemente se dirigió al Fiordo de Nams. El día 13 al empeorarse la situación en Narvik el U48 y los otros uboot se dirigieron a los fiordos de Vest y de Vaags. El día 14 en el fiordo de Vest el U48 atacó al HMS.Warspite pero a causa de unos torpedos defectuosos el ataque no tuvo éxito.
El U48 regresó a Kiel el 20 de Abril de 1940.

6a Patrulla
Zarpa de Kiel el 26 de Mayo de 1940 para patrullar al Noroeste de Cabo Finisterre. El U48 comandado por el KK.Hans Rösing era el comandante táctico de una Manada de Lobos formada por cinco uboot que intentarían interceptar al convoy US3 que tendría que pasar el día 13 al Oeste de Finisterre.
De camino al área designada el U48 hundió al SS.Stancor (británico 798tn) a cañonazos al Noroeste de la Isla de Lewis el día 5 de Junio. A primera hora del día 7 de Junio hundiría al SS.Frances Massey (británico 4.212tn) al Noroeste de Malin Head y dañaría al SS.Eros (británico 5.888tn).
El día 11 el U48 hundiría al SS.Violando N.Goulandris (griego 3.598tn) al Noroeste de Cabo Finisterre. El interceptado del convoy US3 no se realizó y la Manada Rösing fue disuelta.
A primera hora del 19 de de Junio el U48 atacó al convoy HGF34 al Noroeste de Cabo Ortegal y hundiría al MV.Tudor (noruego 6.607tn), al SS.Baron Loudon (británico 3.164tn) y al SS.British Monarch (británico 5.661tn). El día 20 de Junio el U48 hundió a un rezagado del convoy HX49, el buque cisterna MV.Moerdrecht (holandés 7.493tn) al Oeste de El Ferrol.
El U48 regresaría a Kiel el 29 de Junio de 1940.

7a Patrulla
Zarpa el 7 de Agosto de 1940 de Kiel para patrullar al Oeste de las Islas Birtánicas.
A partir del día 13 de Agosto, el U48 intenta atacar, junto al U38 y al U46, al convoy HX62 pero fallan. El día 16 el U48 hunde al SS.Hedrun (sueco 2.325tn) al Suroeste de Rockall y tras la medianoche del día 18 hunde al SS.Ville de Gand (belga 7.590tn) también al Suroeste de Rockall.
El U48 tambien hundió a un rezagado del convoy HX65 en la tarde del día 24, se trata del buque cisterna SS.La Brea (británico 6.666tn) al Noroeste de Rockall, y a primera hora del día 25 de Agosto, en la misma área, hundiría al buque cisterna MV.Athelcrest (británico 6.825tn) y al SS.Empire Merlin (británico 5.763tn) ambos del convoy HX65a.
El U48 regresó a su nueva base de Lorient el 28 de Agosto de 1940.

8a Patrulla
Zarpa de Lorient el 8 de Septiembre de 1940 para patrullar al Oeste de las Islas Británicas.
El U48 bajo el mando del KL Heinrich Carl Bernhard Rudolf Bleichrodt, atacó al convoy SC3 el día 15 de Septiembre al Suroeste de Rockall. Hundiría a 3 buques, el SS.Alexandros (griego 4.343tn), el SS.Empire Volunteer (británico 5.319tn) y a la trainera de la escolta HMS.Dundee.

El día 18 de Septiembre al Oeste de Rockall. el U48 hundiría 3 buques más , el SS.City of Benares (británico 11.081tn), el SS.Marina (británico 5.088tn), y al SS.Magdalena (británico 3.118tn).
Habiendo agotado todos sus torpedos atacando al convoy SC2 el 10 de Septiembre de 1940, el U47 de Prien no podía atacar al convoy HX72 que había localizado el día 20, Prien siguió al convoy y radio su posición a otros uboot. El U48 fue uno de los cinco uboot que formaron una Manada de Lobos para atacar al HX72, el ataque al convoy se canceló cuando por la noche el convoy cambio de rumbo. El U48 guiado por el U47 atrapó al convoy a primera hora del día 21 y hundió al SS.Blairangus (británico 4.409tn) al Sur de Islandia. Persiguió al convoy durante el día y a última hora de la tarde torpedearía y dañaría al SS.Broompark (británico 5.136tn). Este mercante fue hundido por el U552 al Este de Newfounland el 25 de Julio de 1942.
Un total de cinco uboot atacaron al convoy HX72 hundiendo a once buques y dañando a dos más.
El U48 regresó a Lorient el 25 de Septiembre de 1940.

9a Patrulla
Zarpa el 5 de Octubre de 1940 de Lorient para patrullar al Oeste de las Islas Británicas.
A última hora de la tarde del día 11 el U48 divisa al convoy HX77 al Suroeste de Rockall. En dos horas hundiría a tres buques, al MV.Brandanger (noruego 4.624tn), al MV.Port Gisborne (británico 8.390tn) y al buque cisterna SS.Davanger (noruego 7.102tn).
Durante la noche del 16 al 17 de Octubre el U48 contactó con el convoy SC7 al Noroeste de Rockall. El ataque al convoy se saldó con el hundimiento del buque cisterna MV.Languedoc (británico 9.512tn) y del SS.Scoresby (británico 3.843tn), y probablemente dejó dañado al SS.Haspeden (británico 4.678tn). El U48 perdió el contacto con el convoy tras ser alejado por los ataques con cargas de profundidad realizados por un avión Sunderland, tras esto el HMS.Scarborouh lo estuvo acosando durante unas ocho horas. Los ataques al convoy SC7 siguieron los días 18 y 19 de Octubre, un total de 20 buques fueron hundidos y otros 4 dañados por siete uboot. El U48 no volvió a contactar más con el SC7.
El día 18 de Octubre por la mañana hundió al SS.Sandsend (británico 3.612tn) al Sur de Islandia que probablemente se había rezagado del convoy OB22. Tras la medianoche del día 19 hundiría al buque cisterna MV.Shirak (británico 6.023tn) al Suroeste de Rockall, este buque del convoy HX79 estaba detenido tras haber sido torpedeado una hora antes por el U47.
EL U48 regresó a Kiel el 27 de Octubre de 1940.

10a Patrulla
Zarpa de Kiel el 20 de Enero de 1941 para patrullar en el Atlántico al Oeste de las Islas Británicas.
El U48 hundió al SS.Nicolaos Angelos (griego 4.351tn) el día 1 de Febrero al Sur de Islandia.
El día 19 se le ordena al U48 y a otros uboot que se encontraban al Sur de Islandia que pongan proa al Sureste para formar una línea de patrulla por delante del convoy OB217 que había sido localizado por un avión de reconocimiento al Noroeste de Cape Wrath. La inexacta información dada por el avión hizo que la línea de patrulla se creara en el lugar incorrecto y se anuló el día 21.
EL U48 hundiría el día 24 al Suroeste de Fastnet al Nailsea Lass (británico 4.289tn) que se había rezagado del convoy SLS64.
El U48 llegó a su nueva base de St.Nazaire el 27 de Febrero de 1941.

11a Patrulla
Zarpa el 17 de Marzo de 1941 de St.Nazaire para patrullar el Atlántico Norte.
A primera hora de la mañana del día 29 el U48 divisa al convoy HX115 al Sur de Islandia. En varios ataques hunde a tres buques, el SS.Germanic (británico 5.352tn), al SS.Limbourg (belga 2.483tn) y al SS.Hylton (británico 5.197tn)
El 2 de Abril de 1941 el U48 hundiría al buque cisterna SS.Beaverdale (británico 9.957tn) al Suroeste de Reykjavik.
El U48 regresó a St.Nazaire el 8 de Abril de 1941.

12a Patrulla
Zarpa de St.Nazaire el 22 de Mayo de 1941 hacia el Atlántico Norte.

El día 24 los Acorazados Bismarck y Prinz Eugen intentan entrar al Atlántico a través del Estrecho de Dinamarca. La idea era crear una línea de uboot e intentar atacar a las fuerzas británicas que perseguían a los acorazados alemanes al Sur de Cabo Farewell. El plan fue cambiado ya que el Bismarck puso proa a St.Nazaire y el Prinz Eugen hacia el Suroeste. En la noche del 24 al 25 de MAyo el Bismarck sería dañado por un torpedo lanzado por un avión. Para protegerlo al cruzar el golfo de Vizcaya se les ordeno a los uboot que regesaban a su base U74, U97, U98, U109, U556 y a los U48, U73 y U108 que íban a su zona de patrulla, que se reunieran a unas 450 millas al Oeste de St.Nazaire para formara una línea de patrulla hacia el norte desde el Cabo Ortegal. Esto se retrasó a causa del mal tiempo hasta el día 26, el día 26 el Bismarck estaba al noroeste de la línea navegando en paralelo al este de la misma.
El U556 que era el uboot situado más al noroeste, divisó al HMS Ark Royal y a un acorazado que perseguian al Bismarck, al U556 no le quedaban torpedos. A los uboot que todavía tuvieran torpedos se les ordenó ir en ayuda del Bismarck pero el mal tiempo lo hizo imposible, al U556 se le ordenó recuperar el diario de guerra del Bismarck pero no recibió la orden a tiempo.
El Bismarck se hundió la mañana del 27 de Mayo de 1941, el U48, U73 y U108 estuvieron buscando supervivientes hasta el día 31 de Mayo pero no encontraron a ninguno.

El U48 se unió a la Manada de Lobos "West" para patrullar al Norte de la Azores. El 3 de Junio torpedearía y cañonearía al buque cisterna SS.Inversuir (británico 9.456tn) qeu sería finalmente hundido por el U75. El día 5 al hundiría al buque cisterna MV.Wellfield (británico 6.054tn).
Patrullando más tarde en la parte central del Atlántico Norte el U48 hundiría al SS.Tregarthen (británico 5.201tn) al Noroeste de las Azores el día 6 de Junio y al petrolero MV.Pendrecht (holandés 10.746tn) también al Noroeste de las Azores el día 8, este petrolero formaba parte del convoy OB329 antes de que se dispersara. El último buque hundido por el U48 sería el SS.Empire Dew (británico 7.005tn) el día 12 de Junio al Norte de las Azores.
El U48 regresaría a Kiel el 21 de Junio de 1941.

El U48 paso a ser Schulboot y a entrenar a las nuevas tripulaciones sirviendo con la 21 y la 26 Uboot flottillen en Pillau donde fue descomisionado en Octubre del 43. Tras esto estuvo asignado a la 3ULD.
El U48 fue barrenado en Neustadt el 3 de Mayo de 1945.

El U48 fue el mejor uboot de la Segunda Guerra Mundial, tanto en el número de buques hundidos como en el de toneladas hundidas.