2 Patrullas, ningún buque enemigo hundido.

Tras ser comisionado el U6 pasaría a formar parte de la Escuela Uboot de Neustadt. En Septiembre de 1935 formó parte de la Escuela Antisubmarina para llevar a cabo el entrenamiento técnico de las nuevas tripulaciones.
El U6 era un uboot de entrenamiento pero pasó a ser uboot de combate al empezar la guerra.

1a Patrulla
El 24 de Agosto de 1939 zarpa de Neustadt hacía para patrullar el Kattegat en busca de barcos Polacos que intenten escapar hacía Inglaterra. A la mañana del día 31 el U6 informa de la presencia de 3 destructores Polacos saliendo del Kattegat con rumbo al Mar del Norte.
Regresa a la base de Kiel el día 13 de Septiembre.

2a Patrulla
El 4 de abril de 1940 zarpa de Kiel, bajo ordenes selladas, para tomar parte de la operación Hartmut (invasión de Noruega). El día 6 cuando son abiertas las ordenes selladas todos los uboote toman posiciones en las costas Noruegas donde a partir del día 9 dieron apoyo a las tropas alemanas de desembarco y a los transportes marítimos ante posibles ataques de fuerzas británicas.
Al U6 se le ordena formar parte del 8º Grupo Uboot, para operar en las cercanías de Lindesnes, a la mañana del día 9 se encuentra en posición, La misión del grupo era atacar a las fuerzas británicas que se acercaran a la zona desde el norte, el grupo no consiguio ningún contacto.
Amarra en Wilhelmshaven el 19 de Abril de 1940.

El U6 no participo en más operaciones de combate. En Julio de 1940 pasa a entrenar a nuevas tripulaciones en la en la 21.U-Flottille de Pillau.

El día 7 deAgosto de 1944 fue decomisado en Gotenhafen.